การจัดการระบบปลอดเชื้อในเรือสำราญมีความสำคัญต่อวงการสาธารณสุขมาก เนื่องจาก เรือสำราญอาจเป็นสถานที่ที่เป็นสาเหตุของโรคติดเชื้อ ตัวอย่างเช่น เรือสำราญอาจเป็นที่ที่นำส่งคนป่วย และสัตว์พาหะนำโรค เช่น ยุงหรือหนู จากสถานที่หนึ่ง ไปอีกสถานที่หนึ่ง จากท่าเรือหนึ่ง ไปอีกท่าเรือหนึ่ง จากประเทศหนึ่ง ไปอีกประเทศหนึ่ง
มีรายงานการระบาดของโรคติดเชื้อมากกว่า 100 ครั้ง ในระหว่างปี 1970 และ 2003 (Rooney et al., 2004) โรคที่พบในรายงานการระบาด ได้แก่ legionellosis, influenza, typhoid fever, salmonellosis, viral gastroenteritis (e.g. norovirus), enterotoxigenic Escherichia coli infection, shigellosis, cryptosporidiosis and trichinosis. เรือทหารเรือ, เรือขนส่งสินค้า, เรือข้ามฟาก และเรือสำราญ ต่างก็ได้รับผลกระทบ ทั้งในด้านการเงินและการจัดการ